Макар и добре познато, човешкото тяло все още крие някои въпросителни, на които съвременната наука още няма ясен отговор
Физическата сила
Сравнен с шимпанзето, един от най-близките животински видове, човекът притежава два-три пъти по-малко сила, макар че гръдният кош и при двата вида е много подобен. Възможното обяснение е свързано с начина, по който мускулните влакна при човека биват управлявани от нервната му система. Броят на нервните окончания в мускулите варира, което пък повлиява ефективността на самата мускулна маса.
Доминантната ръка
Това е друга загадка, свързана с човешкото тяло и доминирането само на една водеща ръка. Има теория, обясняваща този факт с наличието на сложна система от неврони в онази част от мозъка, която контролира двигателните способности и говора. Тя обикновено е в лявото полукълбо, което отговаря за дясната половина на тялото, и именно по този начин дясната ръка става доминантна. Теория обаче бива опровергана от факта, че не всички десничари контролират своя говор в лявата половина на мозъка, докато при половината левичари това е така.
Апендикс
Някои изследователи считат, че този орган в човешкото тяло може би взема някакво участие при изграждането на имунната система в майчината утроба. Според други пък е своеобразен склад за бактерии, подпомагащи храносмилането, и в него се съхраняват култури, които да се възпроизведат, ако настъпят промени в бактериалния фонд.
Съзнание
Все още не е напълно ясно как 100 млрд. невронни връзки в човешкия мозък се синхронизират, за да създадат усещането за човешка самоосъзнатост. Досега съзнанието е обяснявано чрез биохимията, квантовата механика и спиритизма, но все още то остава огромна загадка.